한국 대학원 진학 언어 (한글 vs 영어)

안녕하세요, 한국에 있는 자연계 대학원 진학을 준비하고 있는 학부생입니다. (한국에 있는 대학 재학 중입니다.)
최근에 면접을 보고 왔는데 저는 전혀 예상치 못한 곳에서 교수님께 쓴소리를 듣고 왔습니다.
자연계 수업을 들으면서 대부분의 강의를 영어로 들었고, 그래서 과제도 영어로 내왔고, 시험도 영어로 써서 냈습니다. 학문 관련해서 워낙 영어만 쓰다보니 어느 순간부터는 학문적인 영역에서는 한글 쓰는게 더 어색하더라구요.
교수님들 개인홈페이지 둘러볼 때도 한국어로 홈페이지 꾸며놓은 교수님은 거의 보지 못했습니다. 다들 영어로 개인 홈페이지 만들어두시더고 영어로된 cv 첨부하셨더라구요.
그래서 저는 대학원부터 학문적인 부분에 대해서는 당연히 영어를 써야하는 것이라고 생각하고 자소서, cv 등등의 모든 서류를 영어로 준비했습니다.
최근에 면접을 보고 왔는데, 면접보신 교수님께서 영어 자소서, 영어 서류에 대해 별로 탐탁치 않아하는 것 같습니다.
부모님께도 얘기해보니 한국에서 대학원 진학하는데 왜 영어로 썼냐고 화내시네요 ...
저는 영어를 사용하는 것이 득이되지 전혀 손해요소로 작용할 것이라고는 생각도 못했습니다.
제가 어제부터 너무 답답하여 열심히 고민해보았습니다. 제가 내린 결론은 한국에서 학자 생활을 하려면 한글을 쓰는 것도 중요하기 때문에 교수님이 그런 반응을 보였다고 결론지었습니다.
혹시 여기 계신 분들은 어떤 생각을 가지고 있는지 알고싶습니다.