대학원 질문입니다... (특이 케이스)

안녕하세요.
현재 s 학부를 졸업 했고(자연과학),
같은 과로 대학원을 가고 싶은 상황입니다.

자대 연구실 인턴을 오래 했어서 교수님껜 죄송하지만..
본가로 내려가서 소소하게 사업 하면서 공부를 겸하고 싶어요.
전공이 여러개라, 다른 전공을 살려 사업을 하고
대학원은 공부를 계속 하고 싶다는 미련&자기만족적인 면이 커요. 느리더라도 박사까지 할 생각은 많습니다.

현재, 본가가 대전이라 충남대나 공주대 대학원을 고민하고 있습니다. 연구실 컨택은 타대라 잘 모르기도 하고, 어차피 한 두개씩 밖에 없어서 연구 주제 더 맞는 곳으로 가려는데 ㅠㅜ

대학원은 학교 이름 상관 없다고 들어왔는데
정말로 그런가요?? 학업 분위기 많이 다를까요??