표절을 안했는데 표절을 했다고 의심받고 있습니다

해외에서 phd중인 사람입니다

박사졸업논문에 들어갈 논문을 교수님께 메일로 첨부하였고 그저께 교수님께 comment sheet를 받았습니다

그런데 제 논문이 온전히 읽혔는지 의심할만한 피드백이 있었습니다

1. 표절이 의심된다 (표 하나 전체를 제가 인용을 하고 출처표시도 명확히 했는데 교수님은 출처표기가 없다고 하시네요)
2. 분석내용이 총 3개라고 써놓았는데 막상 result는 1개밖에 없다. 일부분만 기재하였다 (저는 분명히 3개 다 써 넣었습니다)

제가 파일을 잘못 보낼 가능성을 배제할 수 없어서 연구실내 컴퓨터와 개인컴퓨터 및 아이패드로 전부 확인해봤는데
제가 보낸 파일 자체에는 문제가 없습니다.

그런데 제가 직접 파일을 보낸 것이 아니라 저 > 학과 office > 교수님 순으로 전해졌기 때문에,
학과 office 쪽에서 문제가 발생한 것으로 현재 추정중입니다.

comment sheet에 대한 내용에 대해서는 교수님께서 faculty meeting에서도 언급하셨다고 조교님께 들었습니다.

일단 상황파악을 위하여 교수님께 메일을 2번 보냈으나 전부 묵살당하고
office에 찾아갔으나 안계셔서 연구실로 돌아가는 도중에 교수님을 뵈었습니다.

아무래도 중간에서 파일을 손댄 것으로 의심되는데 어떻게 해야하냐고 여쭤봤는데
"의심에 대한 근거는 있고? 지금 급한거 아니야? 원래 원고를 보내줘야 내가 다시 볼 거아냐?" 라는 답이 돌아왔습니다.

일단 연구실에서 다시 교수님에게 다이렉트로 메일을 보냈고 답변을 기다리는 중입니다.

교수님 컴퓨터에서만 글자가 사라지는 뭐 그런 이상한 일도 종종 발생하는 일인가요?
혹시 비슷한 상황을 겪어보신 분 계신가요? 교수님과의 신뢰관계가 전부 무너진 것 같아 굉장히 당황스럽습니다.