석사 졸업 후, 군입대

안녕하세요
현재 4학년에 올라가는 이공계열 학생입니다.

최근 제가 정말 관심 가는 분야가 생겨서 , 지난 월요일 해당 분야의 자대연구실에 학부 연구생을 받는지 문의를 했습니다.
그런데 교수님께서 우리 랩실로 석사를 진학할 학생만 학부 연구생으로 받고 있다고 하십니다.

여기서 제 고민이 생겼습니다.
저는 집안 내 개인적인 사정으로 학부 졸업 전까지는 군대에 가기가 어렵습니다. (현역입영 대상자이긴 합니다..ㅜ)
그치만 저는 대학원 진학에 큰 뜻이 있고, 기회와 여유가 된다면 박사과정까지 밟을 마음이 있습니다.

그래서 교수님의 권유대로 자대에서 학석사까지 졸업하고 군대를 가게된다면, 전역 후 해외로의 박사 진학이나 취직을 할 때 어려움이 있을까요??