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생물학 실험 데이터 분석에 대한 팁 부탁드려요

IF : 1

2023.03.17

2

548

Differentially Expressed Genes (DEGs), GSEA, Pathway enrichment analysis, Single-cell trajectory analysis 등의 생물학 실험 데이터 분석에 어려움을 겪고 있으신 분들이 사용하시는 유료 분석툴이 있을까요?

배경을 좀 더 설명드리자면 다른 데이터 분석 연구실과 콜라보하거나, 선배한테 물어보거나, 배워서 R을 사용하면 된다는건 알지만,
저희 연구실이 면역학만 다루는 찐 생물학 연구실이어서 아무도 이에 대한 경험이나 지식이 전무합니다 ㅜㅠ

그래서 일단은 연구실에서 돈을 조금 들여서라도 쉽게 기본적인 분석들을 할 수 있는 유료 툴들(혹은 의뢰할 수 있는 곳)을 알아보려고 합니다.

선배님들의 많은 조언 부탁드려요 ㅜㅠㅠㅠ

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댓글 2개

IF : 5

2023.03.17

어떤 툴을 쓰던지간에 내가 분석하고 싶은 것의 배경, 변수, 원하는 결과 등등등등을 갖고 분석해야지 데이터만 걍 쭉 넣는다고 띡 나오는 툴은 없어요. 어디선가 해오더라도 결국 갈아엎고 배워서 하게 될겁니다. 지금 배워서 하시는게 제일 빨라요. 그렇게 스스로 하나하나 익혀서 진행하라고 대학원에서 공부하는 거구요.
허탈한 아리스토텔레스

IF : 1

2023.03.18

Galaxy에서 제공하는 툴들로 많은 분석이 가능할겁니다.
유료건 무료건 요샌 웹툴들도 상당히 잘 나와서 쓸만합니다. 하루 날 잡고 쭉 찾아보세요.

다만, 전사체 분석을 몇 년 간 해보고 느낀 점은 분석 방법의 다양성보다는 핵심적인 유전자 몇개라도 찾아서 의미부여하는게 훨씬 효율적이라는 것이였습니다. 물론 큰그림에서 먼저 보여주고나서..

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