카카오 계정과 연동하여 게시글에 달린
댓글 알람, 소식등을 빠르게 받아보세요

가장 핫한 댓글은?

본문이 수정되지 않는 박제글입니다.

분자생물학도가 전자공학과 분야분들께 실험의 자동화 관련해서 질문드립니다.

건강한 가브리엘 마르케스*

2023.02.09

3

607

안녕하세요. 진화생물학이니 게놈편집이니 유전자네트워크니 하는걸 연구하는 genomics 학도입니다. 손으로 하나하나 실험하는 low throughput실험방식에 한계를 느껴서, 옆동네 공학부 친구들과 협력해서 high throughput으로 설비를 만드는 프로젝트를 (저 혼자) 생각하고 있습니다. 박사중이라 기간은 몇 년이 걸려도 괜찮습니다.

#region 제 실험배경

예를 들면, 최근 저희분야에서 핫한게 single cell RNA-seq이라고 효소처리로 조직을 세포단위로 분산한 뒤 각각의 세포에서 RNA를 읽어내는 방법인데요, 의외로 가장 골치아픈게 어떤 효소를 어떤 농도로 얼마나 처리해야 조직이 깔끔하게 세포단위로 분리되는지 알아내는 단계입니다. 실험자체는 조직을 일정 사이즈로 잘라서 서로 다른 효소 칵테일에 넣고, 조직을 필터해서 버리고, 나중에 세포수와 생존율을 보면 되는 간단한 실험인데, 하나하나 손으로 해야 하다보니 재현성도 떨어지고 시간이 너무 많이 듭니다.

#endregion

그래서 피펫이랑 칼날? 과 필터가 붙어있는 기계를 만들 수 있으면 좋겠다 생각을 하고 있습니다. (아마추어인 제 생각으로) 아무래도 전자공학하시는 분들과 협력을 해야할 것 같은데, 전문가분들께 이하와 같은 질문을 드리고 싶어서 글을 썼습니다.

1. 이런 기계를 만드는 점에서, 전자공학 연구실에 컨택하는게 맞나요? (전기로 작동하는 기계라서 단순히 전자공학이라고 생각했습니다...)
2. 의사소통을 하려면 제가 어느정도 회로라든지, 각 파츠라는지 (예도 못드는 무식함에 얼굴을 들수가 없습니다) 알아야할텐데, 공부를 어디부터 시작해야 할까요? 지금부터 1년정도 (실험으로 바쁘지 않은) 빡세게 공부할 수 있는 기간이 있습니다.
3. 상대방입장에서도 어떤 비전이 보여야 제가 부탁을 드릴텐데, 공학자 입장에서 어떤 메리트가 있나요? 이런 자동화설비를 만들었다, 만으로는 논문이 될 것 같지가 않습니다. 저야 기계가 만들어지면 엄청나게 데이터를 뽑아서 논문도 쓰고 다음 실험의 밑거름이 되고 너무 좋지만…

제 배경지식은, 코딩은 무리없이 할 수 있는데 공학적 지식이 학부때 배운 일반물리학 기본패키지가 전부입니다 (역학, 파동 및 유체역학, 전자기학...의 개론들).

아마 관련 공부하신 분들은 보시면서 많이 답답하셨을 줄 압니다. 얘는 진짜 아무것도 모르는구나… 아무쪼록 귀엽게 봐주시고 귀중한 조언 부탁드리겠습니다. 읽어주셔서 감사합니다.

카카오 계정과 연동하여 게시글에 달린
댓글 알람, 소식등을 빠르게 받아보세요

댓글 3개

2023.02.10

원하시는 부분은.... 학교에서 학생이 하는게 아니라 제작해주는 업체가 있어서 돈주고 제작의뢰합니다.

저런걸 협업하려먼 학문적인 입장이 아니라 창업에 주안점을 두셔야할듯 하고요.

대댓글 2개

해당 댓글을 보려면 로그인이 필요합니다. 로그인하기

해당 댓글을 보려면 로그인이 필요합니다. 로그인하기

댓글쓰기

게시판 목록으로 돌아가기

김박사넷의 새로운 거인, 인공지능 김GPT가 추천하는 게시물로 더 멀리 바라보세요.