석사과정 졸업논문 문제입니다 (전사체 분석 프로그램 사용 여부)

안녕하세요
현재 석사과정으로 재학중인 대학원생입니다.

이제 곧 졸업논문도 써야되서 바쁜 하루를 보내고있는데 한가지 문제가 있어서 여기에 질문드립니다

저희 랩이 wet도 하고 dry도 같이하는 랩이다보니 실험도 하고 그에 대한 RNA-seq을 통해서 EdgeR로 분석도 같이 하고 있습니다

하지만 랩 선배들과는 다르게 전 EdgeR을 하나도 사용할줄 모르는 상태이고요..
배우는데도 시간이 굉장히 오래걸릴꺼같더라고요

지금 하고계신분들도 최소 2년이상은 하신분들이고요

사실 이 랩에 들어오게된 이유는 이런 분석을 보고 들어왔다기보다는 여기서 진행하는 실험 주제들이 제가 미래에 하고자 하는 분야와 잘 맞아서 들어오게됐습니다

아무튼 지금 제 문제는
현재 졸업논문 관련해서 실험을 하고 있는데
RNA-seq 데이터를 사용해야될꺼같습니다
RNA를 뽑고 회사에 보낸다음 저흰 데이터들을 받았고요
그렇다보니 따로 EdgeR을 이용하지 않고 회사 자체에서 제공해주는 프로그램으로 DEGs를 뽑을수도 있더라고요
그리고 Heatmap을 그릴때도 MeV를 사용하고요

하지만 여기서 뽑힌 DEGs들과 그걸 이용해서 뽑은 GO term, KEGG 분석, Heatmap 등등 여러가지 데이터들을 논문에 내도 될지가 문제입니다…

지금까지 본 논문들중에서 Heatmap 그림이라던지 DEGs들을 뽑은 데이터들 중에서 MeV를 사용했다거나 그냥 회사에서 준 프로그램으로 했다고 써놓은 논문을 못봐가지고요..
거의 대부분 EdgeR을 이용해서 volcano plot이라던가 bubble chart같은것도 만들고 여러가지를 만들었다고 써있던데

그렇다고 다른 선배한테 normalized data를 주고 뽑아달라고 하기에는 좀 그럴꺼같아서
제가 직접하는 수밖에 없는데 시간이 오래걸릴꺼같아서 고민입니다…

보통 MeV나 회사에서 주는 프로그램들을 이용해서 그림을 그리거나 DEGs를 뽑아도 되는건가요?