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안녕하세요 학부생 tm값 질문입니다

2024.01.09

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바쁘신데 보시고 답 해주시면 감사하겠습니다. ㅠ
원래 primer design을 할 때 blast를 사용하는데, 원하는게 잘 나오지 않아 직접 디자인 해보려고 합니다.

근데 직접 tm 값을 64.9+41*(G,C 개수 - 16.4)/염기개수 공식(primer nt가 14이상일때 사용하는 공식이라 해서 사용했습니다)를 이용하여 계산한다음 정확히 계산을 했는지 검산하기 위해 thermo tm calculator에 직접 계산하는데 사용되었던 동일한 primer sequence를 기입하여 돌려보았는데, 비교해보니 제가 계산한 값과 너무 다릅니다.
그래서 알아보니 tm 계산법은 정말 여러가지가 있고 tm 계산하는 홈페이지마다 적용되는 공식이 또 다르더라구요

그래서 제가 궁극적으로 궁금한 내용은 디자인 한 primer의 tm값 검증은 제가 계산한것 보다 그냥 제가 주로 주문하는 홈페이지에 있는 tm계산하는데에 기입하여 확인하는게 낫고 정확한가요?

답변해주시면 정말 감사하겠습니다

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댓글 2개

2024.01.09

Cloning만 1000번 넘게 해봤는데 일단 Tm 별로 안중요하고 그냥 사이트 나오는거 믿으면됨

대댓글 1개

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